常见遗留问题包括：合同内/外尾工；协作配套条件变化；“三废”治理；劳保安全措施；工艺设备缺陷。三废治理与劳保安全设施必须与主体工程同时建成投入使用（三同时）；严重危害未解决不得投料试车，环保部门可收费或责令停产。
