影响水体自净作用的主要因素有:污染物质本身的性质和浓度、水体的水情要素、水生生物的活动以及周围环境的影响。水情要素如水温、流量、流速和含沙量对水体自净影响很大:水体流量大、流速快,输送污染物质的能力就强;水温不仅直接影响污染物质的净化过程,还影响水中微生物的活动。